９月16日時点では合計534億円だったが、その後の調査で被害額は拡大し638億8700万円となった。被害は北海道から九州まで26道府県に及んでいる。
　水稲、大豆、野菜などの冠水・倒伏は５万haに及び被害額は55億円となった。農地の損壊は約5000カ所、農業用施設の損壊は約3900カ所に及び、被害額は約160億円に達している。
　林野関係では約409億円、水産関係では約145億円の被害額となっている。