隔離協会は、放射性物質が基準値の100Bq／kgを超えたコメに対して、それを引き取り、隔離保管と廃棄処分を行う。また、その生産者に対しては出荷代金相当額を支払う。その資金は（社）米穀安定供給確保支援機構（米穀機構）の集荷円滑化対策資金から支払うが、生産者への支払金と保管料などの経費はすべて東京電力に損害賠償請求を行い、資金は米穀機構に返済される。
　設立発起人はＪＡ全中、全国主食集荷協同組合連合会（全集連）、米穀機構の３団体。ここに３月27日の臨時総代会で加入を決めたＪＡ全農を加えた全４団体で構成する。
　２月24日に設立総会を行い、３月２日に法人を登記した。
　事務所は東京都中央区日本橋小伝馬町15-15-6階。

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