公共データベースからの「ミツバチ参照遺伝子セット」構築 広島大学2022年11月18日
広島大学大学院統合生命科学研究科の若宮健研究員（当時）と坊農秀雅特任教授、農研機構の横井翔主任研究員の研究グループは、公共の遺伝子発現データからミツバチの参照遺伝子セットを構築。農畜産生物のゲノム編集に向けた、トランスクリプトームデータの解析手法を構築した。
研究の全体図
ミツバチは、蜂蜜の生産や施設栽培の野菜や果物における花粉媒介に不可欠な経済的に重要な昆虫種。そのため、ミツバチの代表的な種であるセイヨウミツバチ（Apismellifera）を中心に昆虫学的な研究において幅広く研究されてきた。
バイオデジタルトランスフォーメーション（バイオDX）は、昆虫を含む様々な生物種における遺伝子情報などの生物に関するデジタルデータを駆使した解析を意味し、この解析の中には遺伝子配列データ解析などが含まれる。これらの解析により、病気に強いミツバチなど、有用な生物機能をゲノム編集で付与することが可能になると期待されている。
再現性のある遺伝子配列データ解析をはじめとしたバイオDXを推進するには、基準となる参照遺伝子セットが必要不可欠。同研究では、公共データベース中から利用可能なセイヨウミツバチの遺伝子発現データをすべて再解析することにより、14万9685種類の転写産物からなる参照転写産物データセットを構築。複数のモデル生物や昆虫種のタンパク質配列データセットを用いて、構築したタンパク質配列の約半分に機能情報を付与（アノテーション）することができた。
構築した参照転写産物データセットの有用性を確認するため、公共データベースにあるトランスクリプトームデータセットを利用した新規の免疫反応関連遺伝子の探索に用いた結果、ウイルスとバクテリアの感染に反応して発現が変動する遺伝子を複数同定。このメタ解析の結果、参照遺伝子セットは、セイヨウミツバチのトランスクリプトーム解析に使えることが示された。この研究で用いられた解析手法は、ミツバチの感染症の研究だけでなく他の研究分野にも展開可能な手法と考えられる。
同研究成果はスイスの出版社 Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)の『Insects』誌に10月14日に掲載された。
重要な記事
最新の記事
-
【注意報】ダイズ、野菜類、花き類にハスモンヨトウ 県内全域で多発のおそれ 滋賀県2025年9月19日 -
農業土木・鳥獣対策でプロフェッショナル型キャリア採用 課長級の即戦力を募集 神戸市2025年9月19日 -
（453）「闇」の復権【三石誠司・グローバルとローカル：世界は今】2025年9月19日 -
ＪＡ全農主催「WCBF少年野球教室」熊本市で27日に開催2025年9月19日 -
「長崎県産和牛フェア」東京・大阪の直営飲食店舗で開催 ＪＡ全農2025年9月19日 -
東京科学大学と包括連携協定を締結 農研機構2025年9月19日 -
素材のおいしさ大切に 農協シリーズ「信州あづみ野のむヨーグルト」など新発売 協同乳業2025年9月19日 -
オートノマス水素燃料電池トラクタを万博で初披露 クボタ2025年9月19日 -
農業の未来を包装資材で応援「第15回 農業WEEK」出展 エフピコチューパ2025年9月19日 -
東尋坊から「崖っぷち米」大手スーパー「ベルク」と直取引で関東圏初進出 福井県坂井市2025年9月19日 -
京橋千疋屋と初コラボ 完熟キウイで「2色のゼスプリキウイ杏仁パフェ」登場 ゼスプリ2025年9月19日 -
まるまるひがしにほん「栃木のおいしさ発掘便」開催 さいたま市2025年9月19日 -
おいしい「ぶどう」日本一は長野県須坂市の横山果樹園「ピオーネ」 日本野菜ソムリエ協会2025年9月19日 -
農業用ビニールハウスの品質が評価「優秀FDI企業トップ20」などに選出 渡辺パイプベトナム2025年9月19日 -
鳥インフル カナダからの生きた家きん、家きん肉等の輸入を一時停止 農水省2025年9月19日 -
宅配事業に新しい形「ナイトチア クロセチン＆セラミド」など新発売 雪印メグミルク2025年9月19日 -
人生100年時代を応援 全年齢型傷害保険「100年保険」新発売 共栄火災海上保険2025年9月19日 -
亀田製菓「午後のつまみ種」キャラメルスナックでおやつ感アップ2025年9月19日 -
家庭菜園ブランド「UETE」に初心者も楽しめる「球根の栽培キット」新登場 タキイ種苗2025年9月19日 -
つなぐミライのタネ「ほっかいどう秋の大収穫祭」10月に開催 北海道2025年9月19日
みどり戦略
注目のテーマ
注目のテーマ
ＪＡ人事
