栽培ギク品種育成で活用 キク属モデル系統の高精度全ゲノム塩基配列を決定2021年10月28日
広島大学大学院統合生命科学研究科の草場信教授と東京大学大学院、かずさDNA研究所、農研機構などの共同研究チームは、栽培ギク（六倍体）によく似た性質を持つ日本原産の二倍体種・キクタニギクの純系化系統（Gojo‐0）の高精度全ゲノム塩基配列を取得し、高精度・染色体レベルで決定することに成功した。
様々な花の形態・花色を持つ栽培ギク
栽培ギクは世界三大花きにも数えられる、日本の切り花生産の3分の1を占める重要な花き品目。栽培ギクの花は江戸時代以前からの長い間の品種改良の結果、多様な形と色があり、その品種分化の解明には興味深いものがある。
いわゆる「菊」は、ゲノムを6セットもつ六倍体であるうえ、自家不和合性であるためヘテロ性が高い。そのゲノム構造は非常に複雑で、栽培ギクで遺伝学的研究を行うのは難しい。この問題を克服するため、栽培ギクに良く似た性質を持つ二倍体種キクタニギクの純系化系統Gojo‐0がモデル系統として開発されている。
全ゲノム塩基配列を用いて作成された分子系統樹
同研究では、栽培ギク（六倍体）によく似た性質を持つ日本原産の二倍体種・キクタニギクの純系化系統Gojo0の高精度全ゲノム塩基配列を取得。キクタニギクの全ゲノムは3.15Gbと比較的大きいが、染色体に対応した9つの連続した配列でその95％をカバーすることができた。キク連の植物において染色体レベルの全ゲノム塩基配列が報告されたのは世界で初めて。キクタニギクのゲノムは栽培ギクのゲノムとよく似ていることが分かり、得られたゲノム情報は栽培ギク品種改良に非常に有用であると考えられる。
キクタニギクゲノムにはレトロトランスポゾンをはじめ、多くの反復配列が含まれていることが分かった。また、今回新たに発見されたレトロトランスポゾンSbdRTは、遺伝子領域周辺に転移しやすいことが明らかになった。
同研究成果は10月7日、科学誌「CommunicationsBiology」にオンラインで掲載された。
重要な記事
最新の記事
-
シンとんぼ（94） －みどりの食料システム戦略対応 現場はどう動くべきか（3）－2024年5月18日 -
みどり戦略対策に向けたＩＰＭ防除の実践（11）【防除学習帖】 第250回2024年5月18日 -
土壌診断の基礎知識（20）【今さら聞けない営農情報】第250回2024年5月18日 -
出生率低下が心配【消費者の目・花ちゃん】2024年5月18日 -
農政 変わるチャンスへ動く年に ＪＡ全青協通常総会2024年5月17日 -
新執行部の決意示す ＪＡ全青協が記者会見で抱負2024年5月17日 -
【注意報】小麦、六条大麦、二条大麦に赤かび病 県内全域で多発のおそれ 栃木県2024年5月17日 -
【注意報】果樹全般にカメムシ類 県内全域で多発のおそれ 大阪府2024年5月17日 -
コメ・水田農業の将来に危機感示した渡辺会長【熊野孝文・米マーケット情報】2024年5月17日 -
【注意報】茶に炭疽病 県内全域で多発のおそれ 長崎県2024年5月17日 -
生命と財産守る活動 一歩ずつ前に ＪＡ共済優績組合表彰式 ＪＡ共済連2024年5月17日 -
（384）本当の「不平等状態」改正【三石誠司・グローバルとローカル：世界は今】2024年5月17日 -
契約実行高、当期純利益で過去最高を更新 2024年3月期決算 ＪＡ三井リース2024年5月17日 -
【ＪＡ人事】ＪＡ帯広大正（北海道）森和裕組合長を再任（5月16日）2024年5月17日 -
北海道HACCP「食の安全にこだわる2024」発行2024年5月17日 -
濃厚マンゴーと相性抜群のスイーツが登場 自由が丘「一果房」で17日から 青木商店2024年5月17日 -
スマート農業システム開発のディーピーティー「JAGRI KYUSHU」に出展2024年5月17日 -
「マッスルスーツ」累計出荷台数が3万台を突破 イノフィス2024年5月17日 -
米・米粉の可能性を広げるBtoB展示会を9月に開催 cotta2024年5月17日 -
農薬出荷数量は6.8％減、農薬出荷金額は3.0％減 2024年農薬年度3月末出荷実績 クロップライフジャパン2024年5月17日
みどり戦略
注目のテーマ
注目のテーマ
ＪＡ人事
