香川県で発生した高病原性鳥インフルエンザの原因ウイルス（香川株）はすでにＨ5Ｎ6亜型であることが明らかになっている。また、このウイルスは静脈内接種試験で鶏を24時間以内に殺す高い病原性も示したという。　今回は、この香川株の8本の遺伝子の断片（遺伝子分節）をこれまでに知られているＡ型インフルエンザウイルスと比較した。
　その結果、8本のうち7本は昨年度ヨーロッパで流行したＨ5Ｎ6亜型に由来し、残る1本のＮＡ型を決めるＮＡ遺伝子はユーラシア大陸の野鳥に分布しているＨｘＮ6亜型（ＨｘとはＨＡ亜型が不明という意味）に由来していることが分かった。農研機構によると、2016－17年にヨーロッパで流行したＨ5Ｎ8亜型高病原性鳥インフルエンザウイルスが渡り鳥の繁殖期に営巣地であるシベリアに運ばれ、そこでＨｘＮ6亜型鳥インフルエンザと一部遺伝子の混合が起きた株が生まれたとしている。これは遺伝子再集合と呼ばれ、由来が異なる2つのインフルエンザウイルスが、同一の細胞に感染した場合、細胞内で遺伝子の混合が起きる現象とされている。
　こうして出現したウイルスが渡り鳥の越冬期に日本に運搬されたと考えられる。また、香川株は昨年12月にオランダでオオカモメから分離された株と99％以上の相同性を示したことから、シベリアからはオランダにも渡り鳥が運んだことが考えられるという。

◆国内には2種類

　一方、昨年11月には島根県のコブハクチョウから同じくＨ5Ｎ6亜型が分離されているが、比較の結果、遺伝子的には近縁だが明確に区別が可能だといい、そのことからこの冬には国内には少なくとも2種類のＨ5Ｎ6亜型高病原性鳥インフルエンザウイルスが侵入していることが考えられるという。

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